Zahnzysten werden in der Regel bei routinemäßigen zahnärztlichen Röntgenaufnahmen entdeckt. Bildgebende Verfahren wie Panoramaröntgen und Kegelstrahl-Computertomographie (CBCT) werden zur endgültigen Diagnose eingesetzt. Falls erforderlich, kann die Art der Zyste durch eine Biopsie bestimmt werden.